自然人李铭因为债务纠纷其持有的A公司的全部55%的股权被冻结，A公司持有B公司90%的股份，此时B公司的股权可以自由转让吗？ 
正常情况下，A对自己持有B公司的股权转让不会受到此类冻结的影响。
这里讲的不受影响，只是相对的，说的是正常情况下的转让，这个转让对价必须是合理的，而不是趁机掏空A公司的资产，进而损害债权人的利益。
我们举个例子，假设B公司的净资产值为1000万元，那么，A公司持有B公司90%的股权，按照净资产值转让的话，此次股权转让A公司应该获得900万元的对价。当然，实际交易过程中可能多于这个数，也可能稍微少于这个数，但基本上不可能出现100万就把它卖掉了。
如果A公司把这90%的股权以100万卖了，那么，通俗地讲A公司就亏了800万，很显然，这就降低了A公司股权的价值，作为A公司的大股东，其持有的A公司的股权也就相应贬值了。很明显就会损害A公司债权人的利益。那么，此时债权人肯定就不乐意了，很可能就会主张行为人与相对人恶意串通损害债权人合法利益，要求法院确认该行为无效。
有人可能会说A公司傻吗？900万的东西卖100万这不亏大了吗？诸位不要怀疑，A公司肯定是不傻，A公司的股东也不傻，之所以会有这种奇葩性的操作，很明显，这里边是有不足为外人道的东西。逃避债务的意图其实也是很明显的。
当然还有一种情况，那就是A公司本身就是一个持股平台，B公司才是真正的实体，才是那个下蛋的鸡，如果A公司把B公司的股权转让以后，A公司只能收得900万元对价，然后A公司就剩一个持有900万元的壳公司了，而B公司本来源源不断的向母公司输送的利润，就被切断了，这种情况有可能也会被认为是故意逃避债务的行为。此种情况并不容易追究其责任。
综上来讲，单纯的从能否转让的角度讲，A公司持有的B公司的股权本身没有被冻结，转让是可以的。但是该转让不得损害债权人的利益,否则可能不会得偿所愿。